《信息学心得》

信息学心得

浅谈对生物信息学的认识

摘要生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究蛋白质及核酸序列等各种生物信息的采集、储存、传递、检索、分析和解读的科学，是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学和化学等学科相互渗透而形成的交叉学科。经过一学期的学习，我学到了很多很有用的知识，给我印象最深的有序列比对、蛋白质结构分析、核酸序列分析、数据库及数据库检索等内容。关键字：生物信息学认识基因组学数据库

时光飞逝，一学期马上就要结束了，本学期的专业选修课也即将结束。在上课之前，我一直认为生物信息学就是在讲关于人类及动物的基因，以及基因之间的差别。但是，刚上了几节课，我就发现生物信息学根本不是我想象的那么简单，就这样我怀着对自己的怀疑和对这门课的好奇走进了这门课。

生物信息学是一门新兴的、正在迅速发展的交叉学科，

美国国家基因组研究中心认为，生物信息学是一个代表生物学、数学和计算机的综合力量的新兴学（bioinformaticsisanemergingscientificdisciplinerepresentingthecombinedpowerofbiology，mathematics，andcomputers）。

现代生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究蛋白质及核酸序列等各种生物信息的采集、储存、传递、检索、分析和解读的

科学，是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、

物理学和化学等学科相互渗透而形成的交叉学科。

在这短短的一学期课中，在老师的带领下，我们学到了很多关

于生物信息学的知识，其中给我印象最深的有序列比对、蛋白质结

构分析、核酸序列分析、数据库及数据库检索等内容。

比如，序列比对，它的基本问题是比较两个或两个以上符号序列

的相似性或不相似性。从生物学角度来看，它包含很多意义；如从

相互重叠的序列片段中重构dna的完整序列等。老师主要给我们介

绍了blast比对。

再如，对蛋白质的分析。比如我们实验测定了一条蛋白质序列

或者从dna序列翻译得来一条蛋白质序列，我们要借助生物信息学

方法来对它进行基本性质及结构分析。其中基本性质包括它的分子

量、氨基酸数目、排列顺序、等电点分析等。结构分析包括跨膜螺

旋分析等。要运用的工具是protparamtool和tmhmm。对于这两

1、现代生物信息学及其主要研究领域萧浪涛（湖南农业大学理学院，湖南长沙410128）

2、生物信息学技术进展郭志云张怀渝梁龙军事医学科学院生物工程研究所，北京100071;四川农业大学生命科学及理学院，雅安625014

3、利用生物信息学技术研究蛋白功能的几种方法王剑利杨章民综述王一理审阅西安交通大学医学院免疫病理学研究室（西安，710061）